MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 34052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014002	GAA	2	6	297480	297485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494960
5002	NC_014002	TCA	2	6	297618	297623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494960
5003	NC_014002	T	6	6	297638	297643	0 %	100 %	0 %	0 %	294494960
5004	NC_014002	CCAT	2	8	297762	297769	25 %	25 %	0 %	50 %	294494960
5005	NC_014002	TTG	2	6	297861	297866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494960
5006	NC_014002	ATA	2	6	297895	297900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494960
5007	NC_014002	TGC	2	6	297965	297970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494960
5008	NC_014002	TGT	2	6	297989	297994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494960
5009	NC_014002	CTC	2	6	298051	298056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494960
5010	NC_014002	GTCCT	2	10	298058	298067	0 %	40 %	20 %	40 %	294494960
5011	NC_014002	T	6	6	298067	298072	0 %	100 %	0 %	0 %	294494960
5012	NC_014002	T	6	6	298108	298113	0 %	100 %	0 %	0 %	294494960
5013	NC_014002	CAA	2	6	298124	298129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494960
5014	NC_014002	G	6	6	298133	298138	0 %	0 %	100 %	0 %	294494960
5015	NC_014002	TCA	2	6	298263	298268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494960
5016	NC_014002	AGC	2	6	298295	298300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494960
5017	NC_014002	CAC	2	6	298306	298311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494960
5018	NC_014002	T	6	6	298358	298363	0 %	100 %	0 %	0 %	294494960
5019	NC_014002	GTT	2	6	298412	298417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494961
5020	NC_014002	CAT	2	6	298462	298467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494961
5021	NC_014002	TAA	2	6	298668	298673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494961
5022	NC_014002	T	7	7	298747	298753	0 %	100 %	0 %	0 %	294494961
5023	NC_014002	CCT	2	6	298754	298759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494962
5024	NC_014002	TTA	2	6	298829	298834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494962
5025	NC_014002	CTT	2	6	298848	298853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494962
5026	NC_014002	CTG	2	6	298890	298895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494962
5027	NC_014002	CAC	2	6	298989	298994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494962
5028	NC_014002	CTG	2	6	299004	299009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494962
5029	NC_014002	TAT	2	6	299106	299111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494962
5030	NC_014002	TGC	2	6	299356	299361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494963
5031	NC_014002	TTC	2	6	299458	299463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494963
5032	NC_014002	CTG	3	9	299556	299564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494963
5033	NC_014002	TGT	2	6	299632	299637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494963
5034	NC_014002	ATGG	2	8	299657	299664	25 %	25 %	50 %	0 %	294494963
5035	NC_014002	CAA	2	6	299688	299693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494963
5036	NC_014002	TCT	2	6	299694	299699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494963
5037	NC_014002	TGGAA	2	10	299702	299711	40 %	20 %	40 %	0 %	294494963
5038	NC_014002	GCTG	2	8	299752	299759	0 %	25 %	50 %	25 %	294494963
5039	NC_014002	GTG	2	6	299831	299836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494963
5040	NC_014002	GGTC	2	8	299865	299872	0 %	25 %	50 %	25 %	294494963
5041	NC_014002	ATG	2	6	299873	299878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494963
5042	NC_014002	TGC	2	6	299934	299939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494963
5043	NC_014002	GAT	2	6	299941	299946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494963
5044	NC_014002	TCG	2	6	299954	299959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494963
5045	NC_014002	TGT	2	6	300021	300026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494963
5046	NC_014002	GCT	2	6	300084	300089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494963
5047	NC_014002	TTCTGC	2	12	300127	300138	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294494963
5048	NC_014002	ACA	2	6	300176	300181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494963
5049	NC_014002	GT	3	6	300182	300187	0 %	50 %	50 %	0 %	294494963
5050	NC_014002	TGC	2	6	300202	300207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494963
5051	NC_014002	CATC	2	8	300255	300262	25 %	25 %	0 %	50 %	294494963
5052	NC_014002	CTT	2	6	300312	300317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494963
5053	NC_014002	TC	3	6	300340	300345	0 %	50 %	0 %	50 %	294494963
5054	NC_014002	ATC	2	6	300542	300547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494964
5055	NC_014002	CCA	2	6	300642	300647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494964
5056	NC_014002	TTC	2	6	300709	300714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494964
5057	NC_014002	ATG	2	6	300728	300733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494964
5058	NC_014002	GC	3	6	300745	300750	0 %	0 %	50 %	50 %	294494964
5059	NC_014002	T	6	6	300800	300805	0 %	100 %	0 %	0 %	294494964
5060	NC_014002	TGT	2	6	300812	300817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494964
5061	NC_014002	GTG	2	6	301163	301168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494964
5062	NC_014002	TTTG	2	8	301176	301183	0 %	75 %	25 %	0 %	294494964
5063	NC_014002	T	6	6	301213	301218	0 %	100 %	0 %	0 %	294494964
5064	NC_014002	TATTGT	2	12	301224	301235	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294494964
5065	NC_014002	AGT	2	6	301277	301282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494964
5066	NC_014002	TGA	2	6	301321	301326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494965
5067	NC_014002	T	7	7	301337	301343	0 %	100 %	0 %	0 %	294494965
5068	NC_014002	TCA	2	6	301458	301463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494965
5069	NC_014002	ACC	2	6	301613	301618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494965
5070	NC_014002	TAC	2	6	301628	301633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494965
5071	NC_014002	CTGG	2	8	301643	301650	0 %	25 %	50 %	25 %	294494965
5072	NC_014002	CAG	2	6	301742	301747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494965
5073	NC_014002	TG	3	6	301749	301754	0 %	50 %	50 %	0 %	294494965
5074	NC_014002	CTG	2	6	301832	301837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494965
5075	NC_014002	CAC	2	6	301865	301870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494965
5076	NC_014002	ACT	2	6	301881	301886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494965
5077	NC_014002	TTC	2	6	301901	301906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494965
5078	NC_014002	ATC	2	6	301919	301924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494965
5079	NC_014002	CTG	2	6	301971	301976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494965
5080	NC_014002	G	6	6	301985	301990	0 %	0 %	100 %	0 %	294494965
5081	NC_014002	AGG	2	6	302003	302008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494965
5082	NC_014002	TATC	2	8	302038	302045	25 %	50 %	0 %	25 %	294494965
5083	NC_014002	T	6	6	302069	302074	0 %	100 %	0 %	0 %	294494965
5084	NC_014002	AAG	2	6	302108	302113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494965
5085	NC_014002	T	7	7	302137	302143	0 %	100 %	0 %	0 %	294494965
5086	NC_014002	CA	3	6	302258	302263	50 %	0 %	0 %	50 %	294494965
5087	NC_014002	TC	3	6	302448	302453	0 %	50 %	0 %	50 %	294494966
5088	NC_014002	ACA	2	6	302455	302460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494966
5089	NC_014002	GGAA	2	8	302529	302536	50 %	0 %	50 %	0 %	294494966
5090	NC_014002	GATG	2	8	302538	302545	25 %	25 %	50 %	0 %	294494966
5091	NC_014002	TCAAGG	2	12	302596	302607	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294494966
5092	NC_014002	TGC	2	6	302672	302677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494966
5093	NC_014002	GATTT	2	10	302747	302756	20 %	60 %	20 %	0 %	294494966
5094	NC_014002	GGC	2	6	302855	302860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494966
5095	NC_014002	TTG	2	6	302899	302904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494966
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5097	NC_014002	A	6	6	303273	303278	100 %	0 %	0 %	0 %	294494966
5098	NC_014002	TCT	2	6	303322	303327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494966
5099	NC_014002	CAG	2	6	303342	303347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494966
5100	NC_014002	TTTA	2	8	303381	303388	25 %	75 %	0 %	0 %	294494966
5101	NC_014002	TC	3	6	303533	303538	0 %	50 %	0 %	50 %	294494967
5102	NC_014002	ATA	2	6	303723	303728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494967
5103	NC_014002	TA	3	6	303892	303897	50 %	50 %	0 %	0 %	294494967
5104	NC_014002	TCT	3	9	303966	303974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494967
5105	NC_014002	GTAC	2	8	304020	304027	25 %	25 %	25 %	25 %	294494967
5106	NC_014002	T	7	7	304132	304138	0 %	100 %	0 %	0 %	294494967
5107	NC_014002	GTC	2	6	304193	304198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494967
5108	NC_014002	TCT	2	6	304228	304233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494967
5109	NC_014002	CTTTT	2	10	304262	304271	0 %	80 %	0 %	20 %	294494967
5110	NC_014002	T	7	7	304268	304274	0 %	100 %	0 %	0 %	294494967
5111	NC_014002	ACA	2	6	304281	304286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494967
5112	NC_014002	CATTT	2	10	304292	304301	20 %	60 %	0 %	20 %	294494967
5113	NC_014002	T	6	6	304350	304355	0 %	100 %	0 %	0 %	294494967
5114	NC_014002	TTG	2	6	304470	304475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494967
5115	NC_014002	CTT	3	9	304497	304505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494967
5116	NC_014002	CAGT	2	8	304533	304540	25 %	25 %	25 %	25 %	294494967
5117	NC_014002	AG	3	6	304604	304609	50 %	0 %	50 %	0 %	294494967
5118	NC_014002	TTTCC	2	10	304646	304655	0 %	60 %	0 %	40 %	294494967
5119	NC_014002	GAT	2	6	304988	304993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494968
5120	NC_014002	CAA	2	6	305072	305077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494968
5121	NC_014002	ATTCC	2	10	305079	305088	20 %	40 %	0 %	40 %	294494968
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5123	NC_014002	TGT	2	6	305284	305289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494968
5124	NC_014002	ATC	2	6	305312	305317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494968
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5136	NC_014002	TA	3	6	305945	305950	50 %	50 %	0 %	0 %	294494968
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5371	NC_014002	CAT	2	6	319710	319715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494984
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5491	NC_014002	AT	3	6	326784	326789	50 %	50 %	0 %	0 %	294494992
5492	NC_014002	AAC	2	6	327013	327018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494992
5493	NC_014002	CAGG	2	8	327065	327072	25 %	0 %	50 %	25 %	294494992
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